Антинаркотическая комиссия Шебалинского района осуществляет свою деятельность во взаимодействии с Антинаркотической комиссией Республики Алтай, территориальными федеральными органами исполнительной власти, органами исполнительной власти Республики Алтай, органами местного самоуправления, организациями и общественными объединениями.